Alta velocidade no processamento do material genético viral do primeiro caso confirmado no Brasil foi possível graças à adaptação de uma técnica já existente
às 16 horas de terça-feira e, às 10 horas da manhã seguinte, o genoma do vírus, que tem quase 200 mil pares de bases [bem mais que as 30 mil do SARS-CoV-2], estava sequenciado e analisado. A metodologia que desenvolvemos é, em média, 45% mais rápida do que as técnicas de metagenômica convencionais. E o custo também é menor, podendo chegar a US$ 30 por amostra”, conta Ingra.
No caso da metagenômica são usados primers aleatórios , que possibilitam sequenciar todo o material genético contido em uma amostra biológica, inclusive o do hospedeiro e de outros agentes causadores de doenças que ele eventualmente traga.e comparadas com um painel de referências. “Exatamente como foi feito com o MPXV. Os dados obtidos foram mapeados em uma sequência do vírus já disponível para estudos.
Como a taxa de erro é um pouco mais elevada que a da plataforma Illumina, a equipe do buscou gerar até 300 leituras redundantes para cada região do genoma viral. “Quando cobrimos diversas vezes a mesma região e encontramos o mesmo resultado, podemos ter certeza de que não se trata de um erro de leitura”, diz a pesquisadora.da varíola dos macacos isolado no Brasil.
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